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省内市级首次!德州疾控完成冷链外包装阳性样本全基因组测序

转载 超级管理员2021/01/15 11:15:45 发布 来源: 作者: 11815 阅读 0 评论 196 点赞

1月11日,德州市疾控中心确定一批次自印度进口的冷冻带鱼外包装新冠病毒核酸检测呈阳性,ORFIab基因Ct值为36.75,N基因Ct值为37.82,随即中心实验室对该样本进行了全基因组测序,经过38小时,1月12日晚9时获得该毒株的全基因组序列,进一步分析得知,该毒株属于L基因型欧洲家系分支I/ B.1.1.32分支基因位点的突变特征,不含有英国新型毒株以及南非新型毒株的氨基酸关键性变异位点,与我国既往已报道的输入性病例以及国内由输入导致的本土聚集性疫情的病毒的基因组不存在关联性。在全球公开数据库检索发现,该毒株的基因组序列与印度8月份上传的基因组序列高度同源。结合流行病学分析,提示该批次产品在始发地印度污染的可能性极大。

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本次德州市疾控中心在冷链食品外包装阳性样本中测序成功,在省内地市级疾控中尚属首次,这标志着德州市疾控中心的基因测序能力走在全省前列。本次测序用时38小时,比预计最短时间提前了10小时,为疫情防控赢得了宝贵时间。今后,德州市疾控中心将利用这一技术平台,深入开展病原体的检测、鉴定和溯源工作。


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